عنوان فارسی مقاله

مجله پرورش و اصلاح نژاد و علم ژنتیک حیوانات
ترجمه مقاله اصلی
اندازه موثر جمعیت نژاد یک گاو سوئیسی بومی برآورد شده از عدم تعادل پیوند
سی. فلوری1 ، ام. تاپیو2، تی. سانستگارد3، سی. دراگمولر4، تی. لیب4، اچ، سیمیانر5، او. هانوته2،6 و اس. رایدر1
1 کالج کشاورزی سوئیس، زالیکوفن، سوئیس
2 موسسه تحقیقاتی بین المللی دام (ILRI)، نایروبی، KY، ایالات متحده آمریکا
3 USDA، مرکز تحقیقات کشاورزی بلتسویل، MD، ایالات متحده آمریکا
4 موسسه ژنتیک، دانشکده وتسوئیس، دانشگاه برن، برن، سوئیس
5 گروه علوم دامی، دانشگاه گئورگ آگوست، گوتینگن، آلمان
6 دانشکده زیست شناسی، ساختمان زیست شناسی، دانشگاه ناتینگهام، ناتینگهام، UK

کلید واژه ها
اندازه موثر جمعیت ؛ عدم تعادل پیوند؛ نژاد های محلی؛ SNP

خلاصه
اندازه موثر جمعیت یک پارامتر مهم برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در درون یک جمعیت دامی و توسعه و پیشرفت آن در طول زمان است. اگر اطلاعات شجره در دسترس نباشد، تجزیه و تحلیل عدم تعادل پیوند (LD) ممکن است چشم انداز متناوبی را برای برآورد اندازه موثر جمعیت ارائه دهد. در این تحقیق، ژنوتیپ 128 نفر از پرورش و اصلاح نژاد ارینگر سوئیس با استفاده از نژاد گاوی ایلومینا SNP50 بیدچیپ مشخص شد. ما اندازه بِن را برحسب 50kb برای تجزیه و تحلیل LD تنظیم کردیم، با این فرض که LD برای تک نوکلئوتید پولیمورفیسم نزدیک مرکز جفت - (SNP)، قدمت دور و درازی از پرورش داشته و در عین حال LD از جفت-SNP دور از مرکز تاریخچه نزدیکی را منعکس می کند. میزان نوترکیبی درمیان نواحی مختلفی از ژنوم متغیر است. کاربرد فاصله فیزیکی به عنوان برآوردی از فواصل ژنتیکی (برای مثال تنظیمِ ، مورگان 1Mb=0.01 ) منجر به جهت گیری در محاسبات میزان موثر جمعیت مبتنی بر LD مربوط به نسل ها تا 50 نسل شده است، در حالیکه محاسبات اخیر بی تاثیر بوده است. اصلاحات مربوط به اندازه محدودِ نمونه بطور قابل ملاحظه ای تاثیری بر این نتایج نداشت. میزان موثر جمعیت واقعی مبتنی بر LD در محدوده 87-149 برآورد شده بود، در حالیکه میزان موثر جمعیت مبتنی بر شجره در 321 فرد حاصل شد.

...

تخفیف ویژه دانشجویی

فقط 20 هزار تومان

نظرات شما عزیزان:

نام :

آدرس ایمیل:

وب سایت/بلاگ :

متن پیام:

نظر خصوصی

 کد را وارد نمایید:

 

 

 

عکس شما

آپلود عکس دلخواه: